一、 主要职责
    市畜牧水产局（市防制重大动物疫病指挥部办公室、市饲料工作办公室）的主要任务是：
（一）宣传、贯彻、执行国家有关畜牧兽医、水产的法律、法规和方针政策。指导畜牧水产业的结构调整，研究提出畜牧业（饲料生产）、渔业养殖发展规划及重大技术措施；
（二）负责兽医医政、兽药药政、渔药渔政和种畜禽、牧草、饲料和饲料添加剂的行政管理工作；
（三）组织实施动物防疫、检疫工作；组织动物疫病控制和扑灭工作；
（四）负责国家、行业、地方相关标准的监督实施；
（五）组织实施畜禽产品、水产养殖安全相关工作的监督管理，组织实施畜禽产品资源和草地资源保护工作；
（六）管理局属下单位，指导乡镇畜牧兽医机构的技术业务工作；
（七）承办市人民政府交办的其他事项。
二、内设机构
市畜牧水产局（市防制重大动物疫病指挥部办公室、市饲料工作办公室）内设人秘股、畜牧兽医股、水产股、饲料监督股、科教股和经营管理股6个机构。
（一）人秘股。协助局领导处理日常事务，起草综合性文件，综合协调各股及属下单位的有关工作；负责组织、人事、劳动和社会保险工作；做好党务、工青妇、计划生育以及文件收发、档案管理、保密、宣传、统计和后勤服务工作。
（二）畜牧兽医股。负责宣传、贯彻、执行国家有关畜牧、兽医、兽药的法律法规和方针政策；负责动物防疫、防疫监督、检疫的管理工作；负责兽医医政、兽药药政和种畜禽、牧草的行政管理工作；组织推广良种良法，推进畜禽养殖方式转变；负责国家、行业地方相关标准的监督实施；组织实施畜产品资源和草地资源保护工作。
（三）水产股。宣传、贯彻、执行国家有关水产的法律法规和方针政策，负责水产种苗、养殖、渔药、渔政的行政管理工作；组织实施水产养殖安全相关工作的监督管理；负责渔业资源增殖保护和管理工作。
（四）饲料监督股。贯彻执行国家有关饲料的法律法规和方针政策，依法对饲料行业的技术标准和产品质量的检查、检测和监督；负责本地饲料、饲料添加剂的行政管理工作。
（五）科教股。管理、指导畜牧水产科研、技术推广和教育培训体系工作；组织重大科研和技术推广项目的遴选及实施；引进动物优良品种和先进技术以及管理科技成果；负责畜牧水产行业有关人员的技术培训和宣传工作。
（六）经营管理股。拟订、落实畜牧水产业产业化规则，指导畜牧水产产业化经营和现代化建设；指导畜牧水产业合作经济组织的建设。